上海第二工业大学学生社团工作由学校党委统一领导，纳入学校思想政治工作和群团工作整体格局。党委学生工作部是学生社团的主管部门，牵头负责学生社团工作，统筹研究规划全校学生社团建设发展，制度性研究涉及学生社团的重要工作和重大事项，负责组织相关部门负责人和有关专家、师生代表开展学生社团建设管理评议相关工作。校团委在学工部指导下，履行学生社团工作的具体管理职能，成立社团管理中心作为学生社团管理部门，负责学生社团建设管理具体事务，承担学校学生社团建设管理日常工作。
学校社团管理工作一直秉承“学习型建设、制度化管理、项目化实施、品牌化经营”的思路，按照“基础建设，品牌打造”的目标，依照《上海第二工业大学学生社团建设管理实施细则》，明确社团发展导向，规范管理社团各项事务。
严格开展社团日常考核、校内外活动审核、年末审核等工作，通过新社团成立答辩、星级社团评选等形式激发社团活力，营造比学赶帮超的良好氛围。截至2023-2024学年春季学期，我校共有46个学生社团。其中思想政治类2个、学术科技类10个、创新创业类7个、文化体育类26个、志愿公益类1个。持续加强社团的思想引领及文化活动育人功能，每个社团均成立社团活动团支部，每月开展特色主题团日活动。组织开展社团文化节、社团体验周、社团主题月、迎新晚会、星级社团展示等品牌活动，积极发挥学生社团在校园文化建设中的作用，丰富学生课余生活，促进大学生德智体美劳全面发展。引导学生社团积极参与社会实践、志愿服务及各类学科竞赛，提升学生社团育人实效。
各类社团不断成长，形成了各自的特色品牌项目，同时也取得了较好的成绩，如物流学会荣获2023年全国大学生标准化奥林匹克竞赛三等奖；航模社荣获2023年中国国际飞行器设计挑战赛一等奖；商道社荣获第十三届全国大学生电子商务“创新、创意及创业”挑战赛乡村振兴实战赛全国总决赛二等奖；物理思创社荣获第九届中国国际“互联网+”大学生创新创业大赛铜奖及2023年TI杯全国大学生电子设计竞赛三等奖；博恩公关协会荣获第九届中国大学生公共关系策划创业大赛二等奖；篮球协会荣获2023上海市学生阳光体育大联赛三对三篮球比赛一等奖；聚点剧社荣获2023年上海市高校“识诈反诈”校园宣传达人大赛二等奖等国家、省市级竞赛百余项荣誉。其中，贰叁陆零都市编舞社荣获2022年上海市高校标杆活力社团、惜源荣获2022年上海市高校活力社团、音极社和博恩公关协会荣获2023年上海市高校活力社团荣誉称号。