上海第二工业大学学生社团工作由学校党委统一领导，纳入学校思想政治工作和群团工作整体格局。党委学生工作部是学生社团的主管部门，牵头负责学生社团工作，统筹研究规划全校学生社团建设发展，制度性研究涉及学生社团的重要工作和重大事项，负责组织相关部门负责人和有关专家、师生代表开展学生社团建设管理评议相关工作。校团委在学工部指导下，履行学生社团工作的具体管理职能，成立社团管理中心作为学生社团管理部门，负责学生社团建设管理具体事务，承担学校学生社团建设管理日常工作。
学校社团管理工作秉承“学习型建设、制度化管理、项目化实施、品牌化经营”的思路，按照“基础建设，品牌打造”的目标，依照《上海第二工业大学学生社团建设管理实施细则》，明确社团发展导向，规范管理社团各项事务。
严格开展社团日常考核、校内外活动审核、年末审核等工作，通过新社团成立答辩、星级社团评选等形式激发社团活力，营造比学赶帮超的良好氛围。全校现有正式注册社团51个，涵盖思想政治、学术科技、创新创业、文化体育、志愿公益等类别。持续加强社团的思想引领及文化活动育人功能，每个社团均成立社团活动团支部，每月开展特色主题团日活动。组织开展社团文化节、社团主题月、迎新晚会、星级社团展示等品牌活动，积极发挥学生社团在校园文化建设中的作用，丰富学生课余生活，促进大学生德智体美劳全面发展。引导学生社团积极参与社会实践、志愿服务及各类学科竞赛，提升学生社团育人实效。